هر چند باکتری ها و ویروس ها موضوعات ایده آلی برای آنالیز بیوشیمیایی می باشند، اگر فرآیند جنسی نداشته باشند برای مطالعات ژنتیکی قابل استفاده نخواهند بود. اگر ما یک فرآیند جنسی را ترکیب مواد ژنتیکی دو فرد تعریف کنیم، چرخه حیات باکتریها و ویروس ها نیز دارای فرآیند جنسی می باشد. هر چند آن ها تولید مثل حنسی به معنی همجوشی گامت های هاپلوئید ندارند با این وجود می توانند در فرآیندی که در آن ماده ژنتیکی از یک سلول باکتری یا ویروس به سلول باکتری یا ویروس دیگر انتقال می یابد شرکت کنند که در طی این فرآیند تولیدrecombinant می کنند. در واقع باکتری ها چهار روش برای بدست آوردن ماده ژنتیکی خارجی دارند : 1)transformation 2)conjugation 3)transduction 4)sexduction شکل زیر فاژها می توانند مواد ژنتیکی را هنگامی که باکتری مورد تهاجم بیش از یک ویریون قرار گرفته است مبادله کنند در طی فرآیند تهاجم ویروس مواد ژنتیکی فاژهای مختلف می توانند نوترکیب شوند. ما فرآیند مبادله ژنتیکی در باکتری ها و باکتریوفاژها را بررسی خواهیم کرد و به دنبال آن نتایج ناشی از آن برای نقشه برداری کروموزومهای باکتری ها و ویروس ها مورد استفاده قرار می گیرد. ( کروموزوم اشاره به یک ساختار در درون سلول باکتری یا درون ویروس دارد که از ماده ژنتیکی ساخته شده است. در یوکاریوت ها از مولکول دو رشته ای DNA و پروتئین تشکیل شده است ) با رنگ آمیزی سلول یوکاریوتی می توان این مواد ژنتیکی را در پروکاریوت ها کروموزوم یک DNAدو رشته ای حلقوی می باشد و در ویروس ها می تواند هر ترکیبی از خطی یا حلقوی، تک رشته ای یا دو رشته ای، DNAویا RNAباشد گاهی به مواد ژنتیکی را مشاهده کرد پروکاریوتی ها و ویروس ها genophoreگفته می شود و لفظ کروموزوم برای ماده ژنتیکی سلول های یوکاریوتی حفظ می شود. ما در این کتاب کروموزوم را برای ماده ژنتیکی همه موجودات زنده و ویروس ها به کار می بریم.